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【基因学苑】生物信息培训VIP课程 - 2022 - 带源码课件

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【基因学苑】生物信息培训VIP课程 - 2022 - 带源码课件
10二代基因组拼接
41了解基因组拼接.mp4 (157.64 MB)
42基因组拼接原理.mp4 (77.06 MB)
43kmer估计基因组大小.mp4 (270.6 MB)
44二代测序拼接算法.mp4 (68.38 MB)
45二代测序拼接实战.mp4 (236.82 MB)
11拼接结果统计及评估
46fasta格式文件介绍与处理.mp4 (206.09 MB)
47quast评估.mp4 (173.69 MB)
48busco评估.mp4 (104.55 MB)
49tablet以及bandage评估.mp4 (476.56 MB)
12基因组拼接探索
50基因组拼接探索.mp4 (287.1 MB)
51混合拼接.mp4 (436.16 MB)
13三代测序基因组拼接
52pacbio及nanopore基因组拼接.mp4 (651.18 MB)
53组装结果纠错.mp4 (421.62 MB)
54细菌完成图.mp4 (434.14 MB)
55不同物种拼接练习.mp4 (290.75 MB)
14基因组序列分析
56原核生物基因预测.mp4 (491.14 MB)
57真核生物基因预测.mp4 (251.43 MB)
58基因功能注释.mp4 (274.25 MB)
59ncRNA分析.mp4 (229.23 MB)
60重复序列分析.mp4 (197.72 MB)
15序列比对
61blast比对.mp4 (216.82 MB)
62blast使用案例.mp4 (693.37 MB)
63全局比对.mp4 (333.78 MB)
16共线性分析
64共线性分析.mp4 (310.01 MB)
65MCScanX共线性分析.mp4 (216.61 MB)
17基因家族分析
66基因家族分析.mp4 (608.01 MB)
18测序数据比对
67测序数据比对.mp4 (291.02 MB)
68段序列比对练习.mp4 (207.85 MB)
69长读长序列比对.mp4 (204.44 MB)
70多重比对问题如何处理.mp4 (68.82 MB)
19sam和bam文件处理
71sam和bam格式文件介绍.mp4 (135.68 MB)
72sam和bam处理案例（上）.mp4 (293.57 MB)
73sam和bam处理案例（下）.mp4 (195.84 MB)
20Linux高级操作
74生物信息常用文件格式.mp4 (166.94 MB)
75正则表达式.mp4 (139.2 MB)
76文件搜索.mp4 (408.35 MB)
77文本筛选grep.mp4 (392.63 MB)
78文本编辑.mp4 (297.28 MB)
21表格处理
79cut-sort-uniq.mp4 (194.6 MB)
80表格处理awk.mp4 (241.65 MB)
81bioawk.mp4 (52.84 MB)
82csvtk.mp4 (99.86 MB)
83datamash.mp4 (142.32 MB)
22shell编程
84shell变量.mp4 (133.08 MB)
85shell循环.mp4 (183.02 MB)
86shell判断.mp4 (54.58 MB)
23生物信息分析服务器简介
87服务器简介.mp4 (109.41 MB)
88硬件选购.mp4 (168.06 MB)
89安装操作系统.mp4 (139.6 MB)
90选择RAID.mp4 (122.04 MB)
91设置云服务器.mp4 (114.58 MB)
92yum工具.mp4 (222.74 MB)
93磁盘操作.mp4 (107.84 MB)
24生物信息分析平台搭建
100配置R语言分析环境.mp4 (195.1 MB)
101安装网络应用.mp4 (78.08 MB)
94基础环境配置.mp4 (296.75 MB)
95升级centos-stream.mp4 (96.32 MB)
96重置服务器练习.mp4 (184.24 MB)
97用户管理.mp4 (303.28 MB)
98配置生物软件.mp4 (239.72 MB)
99配置生物数据库.mp4 (86.35 MB)
25ubuntu系统配置
102ubuntu系统配置.mp4 (156.22 MB)
103虚拟机安装ubuntu.mp4 (56.58 MB)
26R语言基础入门
104R语言简介.mp4 (98.54 MB)
105R语言以及Rstudio安装.mp4 (128.98 MB)
106rstudio设置.mp4 (238.76 MB)
107开始使用R.mp4 (311.41 MB)
108R环境设置.mp4 (186.37 MB)
109R包管理.mp4 (398.24 MB)
110文件操作.mp4 (295.31 MB)
27R数据结构
111向量.mp4 (150.78 MB)
112向量索引.mp4 (294.3 MB)
113矩阵.mp4 (126.21 MB)
114数据框.mp4 (422.41 MB)
115因子列表缺失数据.mp4 (270.18 MB)
28R数据处理
116数据处理.mp4 (267.12 MB)
117数据转换.mp4 (447.32 MB)
118随机抽样以及数据探索.mp4 (380.76 MB)
119分组计算以及数据透视表.mp4 (298.2 MB)
120tidyverse.mp4 (300.81 MB)
121dplyr数据处理.mp4 (383.6 MB)
29R统计检验
122独立性卡方检验.mp4 (219.38 MB)
123独立性t检验.mp4 (461.95 MB)
124相关性检验.mp4 (98.41 MB)
30R统计建模
125统计建模.mp4 (291.77 MB)
126购物篮分析.mp4 (270.01 MB)
127机器学习预测乳腺癌.mp4 (290.96 MB)
31R基础绘图
128R语言技巧.mp4 (140.61 MB)
129R基础绘图.mp4 (246.87 MB)
130直方图.mp4 (490.47 MB)
131饼图以及扇形图.mp4 (101 MB)
132条形图以及分组条形图.mp4 (231.87 MB)
133箱线图以及小提琴图.mp4 (145.77 MB)
134韦恩图.mp4 (225.6 MB)
135绘图布局.mp4 (181.97 MB)
32ggplot2绘图
136ggplot2绘图.mp4 (153.84 MB)
137ggplot2散点图直方图条形图.mp4 (363.93 MB)
138ggplot2分组条形图以及箱线图.mp4 (512.19 MB)
139ggplot2小提琴图以及主题设置.mp4 (245.77 MB)
140ggplot2扩展.mp4 (507.47 MB)
141科学文献绘图.mp4 (535.59 MB)
33基因表达调控简介
142基因表达调控.mp4 (191.25 MB)
143GEO数据库简介.mp4 (231.89 MB)
144关于基因的概念.mp4 (75.72 MB)
34RNAseq概述
145RNAseq简介.mp4 (208.82 MB)
146RNAseq原理.mp4 (208.44 MB)
147RNAseq建库方法.mp4 (182.15 MB)
148RNAseq不同测序平台比较.mp4 (159.27 MB)
149RNAseq定量方法.mp4 (278.43 MB)
35RNAseq分析
150RNAseq分析环境搭建.mp4 (65.88 MB)
151Bioconductor.mp4 (245.71 MB)
152下载参考序列.mp4 (492.71 MB)
153下载练习数据.mp4 (326.77 MB)
154数据质控过滤.mp4 (425.05 MB)
155hisat2建立索引.mp4 (142.87 MB)
156hisat2比对.mp4 (240.31 MB)
157featureCounts计数.mp4 (131.42 MB)
158STAR比对.mp4 (163.17 MB)
159HTSeq-count计数.mp4 (159.83 MB)
36利用R分析RNAseq数据
160DESeq2分析RNAseq数据.mp4 (411.71 MB)
161DESeq2练习.mp4 (117.1 MB)
162edgeR分析RNAseq数据.mp4 (391.21 MB)
163edgeR练习.mp4 (272.1 MB)
37差异表达基因注释以及富集分析
164差异表达基因功能注释.mp4 (336.19 MB)
165富集分析.mp4 (386.1 MB)
166注释富集练习.mp4 (151.1 MB)
167非模式生物注释富集.mp4 (195.19 MB)
168GSEA分析.mp4 (584.03 MB)
38单细胞测序概述
169单细胞测序概述.mp4 (295.76 MB)
170单细胞测序原理.mp4 (291.58 MB)
171_10xgenomics资源以及常见问题.mp4 (185.68 MB)
39单细胞测序数据分析
172单细胞分析环境搭建.mp4 (307.2 MB)
173利用cellranger分析单细胞数据.mp4 (370.85 MB)
174结果解读.mp4 (195.2 MB)
175LoupeBrowser.mp4 (97.35 MB)
176_10x练习数据.mp4 (140 MB)
40利用Seurat分析单细胞数据
177安装Seurat.mp4 (285.38 MB)
178Seurat读取数据.mp4 (137.62 MB)
179质控过滤以及标准化.mp4 (184.39 MB)
180聚类.mp4 (241.5 MB)
181细胞亚群分类.mp4 (326.46 MB)
182寻找marker基因以及细胞鉴定.mp4 (442.69 MB)
183Seurat练习.mp4 (388.98 MB)
43空间转录组
192空间转录组.mp4 (117.4 MB)
44宏基因组简介
193宏基因组简介.mp4 (388.23 MB)
194宏基因组建库测序.mp4 (140.63 MB)
45宏基因组分析环境搭建
195宏基因组分析环境搭建.mp4 (216.17 MB)
196国内镜像下载宏基因组数据库.mp4 (148.87 MB)
46三代nanopore测序宏基因组数据分析
197物种分类原理.mp4 (127.04 MB)
198centrifuge安装.mp4 (218.87 MB)
199centrifuge数据库.mp4 (156.53 MB)
200三代测序宏基因组物种分类鉴定.mp4 (391.57 MB)
201pavian结果可视化.mp4 (227.17 MB)
202物种分类练习.mp4 (232.66 MB)
47临床病原微生物检测
203临床样本病原微生物检测.mp4 (241.81 MB)
204批量进行致病菌鉴定.mp4 (237.44 MB)
48二代宏基因组测序数据分析
205二代宏基因组分析软件安装.mp4 (251.7 MB)
206二代宏基因组分析数据库下载.mp4 (535.19 MB)
207kneaddata质控.mp4 (244.2 MB)
208metaphlan物种分类.mp4 (298.17 MB)
209humann功能分析.mp4 (145.65 MB)
49宏基因组分析结果可视化
210megan物种分类结果可视化.mp4 (321.17 MB)
211stamp分组比较.mp4 (241.72 MB)
50二代宏基因组拼接
212二代宏基因组模拟数据拼接.mp4 (282.89 MB)
213二代宏基因组真实数据拼接.mp4 (424.65 MB)
51三代纳米孔宏基因组拼接
214三代纳米孔宏基因组拼接.mp4 (227.01 MB)
215nanopore模拟数据拼接.mp4 (509.61 MB)
216nanopore宏基因组真实数据拼接.mp4 (285.34 MB)
217纳米孔组装纠错.mp4 (287.53 MB)
52宏基因组功能分析
218宏基因组基因预测.mp4 (285.85 MB)
219cdhit去冗余.mp4 (215.29 MB)
220宏基因组基因功能注释.mp4 (203.61 MB)
221宏基因组定量分析.mp4 (247.76 MB)
53metawrap分箱
222metawrap分箱.mp4 (182.9 MB)
223metawrap配置.mp4 (304.89 MB)
224metawrap案例.mp4 (260.93 MB)
54扩增子分析简介
225扩增子测序简介.mp4 (314.66 MB)
226OTU还是ASV？.mp4 (129.86 MB)
227alpha和beta多样性.mp4 (208.72 MB)
228.16S分析环境搭建.mp4 (376.98 MB)
229metadata.mp4 (56.07 MB)
230探索16S序列.mp4 (159.31 MB)
55利用qime2分析16S数据
231qiime2简介.mp4 (224.19 MB)
232qiime2导入数据.mp4 (472.82 MB)
233qiime2实战.mp4 (432.3 MB)
234多样性分析.mp4 (359.43 MB)
235物种分类鉴定及可视化.mp4 (223.45 MB)
236不同组间丰度差异比较.mp4 (218.83 MB)
56利用R分析16S数据
237拆分barcode.mp4 (145.84 MB)
238利用dada2处理16S数据.mp4 (471.17 MB)
239dada2物种分类鉴定.mp4 (269.36 MB)
240dada2练习案例.mp4 (204.37 MB)
241利用phyloseq可视化结果.mp4 (198.24 MB)
242.16S功能分析.mp4 (145.82 MB)
57人基因变异检测
243人基因组分析简介.mp4 (204.58 MB)
244全基因组与外显子和panel测序.mp4 (116.58 MB)
245参考序列的影响.mp4 (86.87 MB)
246拼接与reads比对方法比较.mp4 (160.55 MB)
58人基因组数据分析环境搭建
247人基因组分析环境搭建.mp4 (416.01 MB)
248瓶中基因组.mp4 (130.94 MB)
59二代测序变异检测
249gatk简介.mp4 (144.75 MB)
250变异检测原理.mp4 (90.91 MB)
251生成bam.mp4 (422.62 MB)
252bam文件处理.mp4 (512.93 MB)
253gatk变异检测.mp4 (419.13 MB)
254外显子与panel数据分析.mp4 (244.86 MB)
255vcf文件.mp4 (657.06 MB)
256snp注释.mp4 (508.61 MB)
60三代纳米孔变异检测
257纳米孔测序变异检测原理.mp4 (88.53 MB)
258纳米孔数据比对.mp4 (93.72 MB)
259纳米孔测序SNP与SV检测.mp4 (368.46 MB)
61igv变异可视化
260igv变异可视化.mp4 (178.96 MB)

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嘀嘟*享

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256
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2023-08-15

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